寿司のバーコーディングについての紹介記事
「生物の科学 遺伝」2010年5月号 (Vol.64 No.3)に、 以前も紹介したDNAバーコードを用いた寿司の同定についての論文
の紹介記事が掲載されています。
合わせて、DNAバーコードやその現状についての簡単な解説がありますので、興味のある方はぜひご覧ください。
2010 年 4 月 25 日 4:09 PM
ニュース カテゴリー：文献
DNAバーコードを用いた寿司の同定
11月24日付のWeird Visionの記事
でDNAバーコードによるマグロ属（Thunnus）の同定についての論文
が紹介されています。記事内容について、若干の補足も含めて解説します。
まず記事の補足です。動物で用いられているDNAバーコードは、一本の染色体全てを読むのではなく、ミトコンドリアの持つDNAの一部について、その配列を読みとって利用する手法です。記事ではミトコンドリアのCOI遺伝子14箇所を選んだと書かれていますが、厳密には読み取ったCOI遺伝子の部分的な配列のうち14箇所、ということになります。
論文では、マンハッタン・デンバー・コロラドの計31の寿司店でマグロを注文し(価格は$2.25～$15)、店員から種名を確認した上で、寿司ネタ(可能であれば刺身)からDNAを抽出、バーコードを特定しました。
COIバーコードを構成する655塩基のうち、マグロ属の識別に有効であると考えられた14塩基をデータベース内にある配列と比較した結果、マグロ属では99％以上の確率で種名が特定されました。また、White tuna（ビンナガ）とされていながら、いずれのマグロにも該当しなかった5サンプルについては、配列全体を用いてデータベースで検索を行ったところ、データベース内の魚類では、ワックス毒魚とされるアブラソコムツ(Lepidocybium flavobrunneum)に最も近い配列である、という結果が得られました。
現在のところ、DNAバーコードを迅速に決定することは技術的に困難であり、種名を特定するには、一日程度かかりますが、本研究は、DNAバーコードによってより迅速な種同定が可能になったとき、それがどのような利用法を持つかを示す一つのモデルケースです。
2009 年 11 月 25 日 8:20 PM
植物バーコード領域のケーススタディー
陸上植物の標準的バーコード領域（rbcL、matK）を用いた研究が，PLoS ONE と ＰＮＡＳに掲載されました． いずれの論文もオープンアクセスです．
- M. A. Gonzalez et al. (2009) Identification of Amazonian Trees with DNA Barcodes. PLos ONE 4 (10):e7483.
- W. J. Kress et al. (2009) Plant DNA barcodes and a community phylogeny of a tropical forest dynamics plot in Panama. Proc Natl Acad Sci USA: Early Edition.
2009 年 11 月 5 日 12:25 PM
陸上植物の標準的バーコード領域
Consortium for the Barcode of Life (CBOL) の Plant Working Groupにより，陸上植物の標準的バーコード領域としてrbcLとmatKの利用を推奨する提案がPNASに掲載されました．今後２ヶ月のうちにこの案で植物の標準的バーコード領域が正式決定される予定です．
2009 年 8 月 7 日 1:48 PM
「昆虫と自然」2009年3月号に特集記事が掲載されました。
特集「昆虫のDNAバーコーディング」
前藤 薫 「昆虫の検索・同定と情報集積のための新しいツール」
神保 宇嗣 「DNAバーコーディングの概要と同定支援システム」
吉武 啓 他 「甲虫のDNAバーコーディング」
多田内 修 「ハナバチ類のバーコーディングプロジェクトBeeBOL」
三浦 一芸 「種識別DNAマーカーの生態学・応用昆虫学への応用」
2009 年 3 月 27 日 8:05 PM
「生物の科学 遺伝」の概説記事
「生物の科学 遺伝」 2007年7月号に概説記事が掲載されました。
- 伊藤元己・神保宇嗣・吉武啓, 2007.DNAバーコーディング－新たな生物多様性研究手法. 遺伝 61: 42-47.
2007 年 7 月 7 日 12:00 PM
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